Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ZNF56Q15929 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ZNF56Q15929 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms