Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms