Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACSM1Q08AH1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms