Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC3A1Q07837 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms