Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PPARDQ03181 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms