Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT3P49368 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT3P49368 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT3P49368 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT3P49368 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT3P49368 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT3P49368 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT3P49368 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT3P49368 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT3P49368 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT3P49368 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCT3P49368 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT3P49368 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms