Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA9P31269 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms