Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUP10909 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUP10909 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms