Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PDE6DO43924 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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