Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
KLF12Q9Y4X4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms