Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCDHA12Q9UN75 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms