Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF346Q9UL40 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF346Q9UL40 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms