Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIN28AQ9H9Z2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms