Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms