Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLRP1Q9C000 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP1Q9C000 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms