Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BCO2Q9BYV7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms