Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
MAP1LC3CQ9BXW4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms