Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JSRP1Q96MG2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms