Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPAP2Q8IXW5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms