Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDP4

KLHL17, Kelch-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL17Q6TDP4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL17Q6TDP4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms