Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TYW3Q6IPR3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms