Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM78BQ5VT40 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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