Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms