Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HSD17B12Q53GQ0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms