Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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RTL8BQ17RB0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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RTL8BQ17RB0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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