Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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