Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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BRD3Q15059 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRD3Q15059 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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