Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP1A4Q13733 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1A4Q13733 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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