Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IKZF1Q13422 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms