Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A3Q01959 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms