Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A3P48751 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms