Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRATP43155 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CRATP43155 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRATP43155 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms