Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP1P29466 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP1P29466 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP1P29466 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP1P29466 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP1P29466 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP1P29466 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP1P29466 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP1P29466 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP1P29466 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP1P29466 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP1P29466 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP1P29466 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP1P29466 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP1P29466 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP1P29466 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP1P29466 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP1P29466 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP1P29466 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP1P29466 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP1P29466 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP1P29466 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP1P29466 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP1P29466 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP1P29466 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP1P29466 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP1P29466 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP1P29466 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP1P29466 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASP1P29466 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASP1P29466 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP1P29466 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP1P29466 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms