Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
GJB2P29033 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GJB2P29033 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GJB2P29033 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
GJB2P29033 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GJB2P29033 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GJB2P29033 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GJB2P29033 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJB2P29033 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJB2P29033 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms