Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSSP25774 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTSSP25774 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTSSP25774 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTSSP25774 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTSSP25774 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTSSP25774 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSSP25774 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSSP25774 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms