Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNP07948 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNP07948 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNP07948 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNP07948 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNP07948 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNP07948 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LYNP07948 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LYNP07948 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LYNP07948 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNP07948 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNP07948 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNP07948 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNP07948 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNP07948 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNP07948 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNP07948 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNP07948 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNP07948 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNP07948 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNP07948 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNP07948 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNP07948 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNP07948 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNP07948 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LYNP07948 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms