Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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PDE6DO43924 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDE6DO43924 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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