Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms