Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNX8Q9Y5X2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms