Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms