Protein–RNA interactions for Protein: Q9P000

COMMD9, COMM domain-containing protein 9, humanhuman

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD9Q9P000 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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COMMD9Q9P000 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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COMMD9Q9P000 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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COMMD9Q9P000 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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COMMD9Q9P000 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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COMMD9Q9P000 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COMMD9Q9P000 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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