Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VN1R3Q9BXE9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms