Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms