Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NUP58Q9BVL2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms