Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL2Q9BQD1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms