Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC4Q8WW27 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms