Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BHLHE22Q8NFJ8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE22Q8NFJ8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms