Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC6BQ86SZ2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms