Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BEND4Q6ZU67 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms