Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ANKRD39Q53RE8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms